北方基因 美分离出近八千种人体消化道菌株样本
时间:2019-09-04 19:06 作者:北方基因 来源: 点击:次
人体消化道是不计其数种不同细菌的家乡。
北方基因得悉美国麻省理工学院和布罗德研讨所目前已别离保存了近8000种人体消化道菌株的样本,并提醒了其遗传和代谢布景。相关研讨发表在最新一期《自然·医学》上。
研讨小组在长达两年的时刻里搜集了大约90人的粪便样本,深化了解了微生物种群在个体内的改变情况。这项研讨的重点是生活在波士顿区域的人们,但研讨小组也在搜集来自全球各地的更多样本,期望可以保留生活在工业化社会中的人们所没有的微生物菌株。
研讨人员从主导人类胃肠道的6种主要细菌门类中别离出总共7758种菌株,并对其间3632个菌株进行了全基因组测序。通过剖析单个宿主中微生物种群随时刻的改变,发现了菌株之间的一些新的相互作用。在一个案例中,他们发现3种相关的拟杆菌菌株在宿主体内共存,所有这些菌株好像都与宿主体内的一个祖先菌株不同;在另一个案例中,一株菌株几乎在一夜之间彻底替代了相同物种的相关菌株。
研讨人员还测量了粪便样本中发现的许多代谢物的数量。该剖析显示,氨基酸水平的改变与单个人体内微生物种群随时刻的改变密切相关。而且,不同人群中微生物种群组成的差异与不同水平的胆汁酸密切相关,胆汁酸有助于消化。研讨小组将在未来研讨中持续探求这些氨基酸和胆汁酸水平差异的发生原因。
本研讨所别离的细菌菌株样本的所有数据已提供在线,使其他科学家可以研讨这些菌株的功用及其在人类健康中的潜在作用。
研讨人员表示,全面和高分辨率的细菌别离物搜集开启了机制性研讨生活方式如何刻画人体肠道微生物组、新陈代谢和炎症的可能性。该数据集(BIO-ML)有助于提醒人体肠道中微生物种群的动态改变,并帮助科学家开发针对多种疾病的新疗法。
总编辑圈点
肠道内的微生物有多少?曩昔咱们只能说,不计其数种,好几公斤重。而此次通过“拉网式”查询,咱们拟出了相对翔实的清单。曩昔只能抽象地说,肠道菌群在消化和免疫中是不可或缺的主角;而通过调查它们随时刻的改变,以及剖析代谢物,咱们将辨认出每一种微生物的人物,由此治疗各种恶疾。
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